1. 噬菌体疗法的研究及应用现状
近年来，耐多药（MDR）细菌的迅速出现促使人们寻找新的、更有效的抗菌药。面对这一棘手问题，噬菌体作为抗生素的潜在替代品重新引起了公众的注意。噬菌体（phage）是一类感染细菌宿主的病毒。早在100年以前，噬菌体就进入了科学家的视野，但是由于抗生素的发现和广泛使用，严重阻碍了噬菌体的发展。然而，随着近几年抗生素耐药性的普遍出现，“噬菌体疗法”正在被重新重视[1, 2]。2006年，美国食品药品监督管理局（FDA）批准了首个用于控制李斯特菌的噬菌体鸡尾酒ListShield?。之后，多种商业化噬菌体产品被用于食品生物防治[3-5]，这表明美国FDA承认噬菌体是安全、有效的。2016年，为救治一位严重耐药鲍曼不动杆菌感染的患者，美国医生通过向美国FDA提交紧急使用研究性新药申请，开展了美国近年来的第一次噬菌体治疗[6]。这一案例引起了全球科研工作者对于噬菌体治疗的兴趣，也受到了美国FDA的高度关注，FDA多次召开专题会议，进一步研究噬菌体治疗的监管方案，以更好地对其推广应用。
目前，我国上海市公共卫生中心噬菌体研究所利用噬菌体治疗耐药性细菌如鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷佰菌等引起的难治性感染取得成功，在我国开启了噬菌体治疗的新征程。2023年，欧洲药监局发布全球首个噬菌体兽药质量、安全性和有效性科学指南，该指南的出台有望推进或加速兽用噬菌体产品及原料的审批和上市。可见，噬菌体疗法在人医和兽医领域的临床应用趋向于更合法合规。
2. 噬菌体在禽沙门菌的应用
噬菌体在治疗家禽细菌性疾病方面被证明是可行的。在家禽养殖业中，噬菌体治疗沙门菌有两个基本目的。首先，噬菌体治疗可以最大限度地减少细菌性病原体对动物健康和生产影响所造成的损失。第二，以噬菌体为基础的生物防治被认为是控制人类食源性病原菌感染的有力工具。噬菌体在预防和治疗家禽大肠杆菌病一直有很好的效果。在对抗各种沙门菌血清型（如肠炎或鼠伤寒沙门菌）或弯曲杆菌引起的感染上也获得了明显的效果。
噬菌体的治疗效果取决于合适的噬菌体类型、噬菌体滴度、应用方式和应用时间等[7, 8]。噬菌体鸡尾酒可以通过不同的方法给药，例如，添加到饮用水中饮用或作为饲料添加剂喂食，也可通过在鹅蛋上喷洒，或通过直接在受污染的产品中添加噬菌体裂解液。因此，噬菌体可能是抑制沙门菌的水平和垂直传播的一种很有前途的干预策略。在将孵化的受精蛋从恒温箱转移到孵化器的过程中，使用噬菌体作为气溶胶喷雾可能是减少沙门菌通过卵水平传播的一种经济有效的方法[9]。一项通过口服接种噬菌体制剂来减少沙门菌在鹅体内的定植的研究表明，噬菌体的使用可能对控制该病原体的垂直传播有较好的效果[10]。在所有已鉴定的沙门菌噬菌体中，最著名的是P22和Felix-O1。Felix-O1是一种广谱的裂解性噬菌体，可以裂解多种沙门菌血清型，被认为是治疗和诊断应用的有效候选药物[11]。沙门菌噬菌体SalmoFREE?产品由六种沙门菌烈性噬菌体的混合物组成，在家禽生产系统中被大规模使用评估[12]，通过饮水多次服用，结果表明SalmoFREE控制了沙门菌的发病率，未发生其它不良影响，证明了噬菌体的有效性和无毒性。
3. 噬菌体鸡尾酒可以规避单一噬菌体的有限宿主谱和噬菌体抗性菌的出现
噬菌体高度的宿主特异性是区别于抗生素的一个重要特征。宿主特异性是一把“双刃剑”，一方面高度特异性使噬菌体仅杀死目标细菌，而不会破坏共生的正常菌群[13]。另一方面，宿主特异性也影响了噬菌体的宿主范围，严重限制了噬菌体的应用。此外，在噬菌体治疗的过程中，由于细菌中含有多种防御系统并且细菌表面受体容易发生突变，导致细菌对噬菌体产生抗性，从而无法裂解该细菌。为了克服这种局限性，可以使用噬菌体鸡尾酒，即多种噬菌体进行组合调配，可以很好的规避单一噬菌体的有限宿主谱和噬菌体抗性菌的出现[14, 15]。虽然噬菌体鸡尾酒在一些临床应用中已被证明是可行的[16, 17]，但噬菌体鸡尾酒制剂并不是各种不同噬菌体的随机混合，而是通过理论上的优选或排除等优化设计，基于科学试验得出的不同噬菌体混合物[18]。噬菌体鸡尾酒中的噬菌体越多，其药代动力学、药效学和安全性就越难预测，生产也越发复杂[19]。
一般在噬菌体鸡尾酒的配置过程中，应该考虑受体多样、吸附能力强、潜伏期短、裂解量大的噬菌体。在噬菌体鸡尾酒的配制过程中，也可以考虑使用宿主范围广泛的噬菌体，以减少鸡尾酒中噬菌体的数量。噬菌体鸡尾酒也可以通过鉴定靶向宿主菌不同受体的噬菌体，以不同受体的噬菌体配置噬菌体鸡尾酒[20]。如前所述已经介绍细菌对噬菌体感染的易感性最初取决于噬菌体能否吸附到细菌细胞表面的受体上，细菌经常通过细菌的受体突变来阻止噬菌体的感染。使用靶向不同受体的噬菌体配置鸡尾酒通常是首选的[21]，因为不同的受体单点突变可能不会同时发生。
4. 沙门菌高效噬菌体鸡尾酒的研制
随着人们对食品安全和卫生的关注度越来越高，禽产业链的动物源性食品安全越来越受到关注。沙门菌是禽产业链上最常见的细菌之一，它会严重威胁人们的健康。本研究针对禽感染或禽相关产品污染沙门菌的问题，寻找一种高效的裂解性噬菌体作为一种绿色生物防治剂，减少抗菌药物的使用，避免多药耐药菌株对环境的污染和对人体健康的危害。为了更好的发挥噬菌体的杀菌效果，减少噬菌体抗性突变体的产生。本研究利用噬菌体靶向的细菌受体作为设计噬菌体鸡尾酒的标准，探究噬菌体鸡尾酒在体内和体外的杀菌效果。
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